離子色譜儀主要用于環境樣品的分析，包括地面水、飲用水、雨水、生活污水和工業廢水、酸沉降物和大氣顆粒物等樣品中的陰、陽離子，與微電子工業有關的水和試劑中痕量雜質的分析。另外在食品、衛生、石油化工、水及地質等領域也有廣泛的應用。
　　離子色譜儀對進樣器的基本要求是：耐高壓、耐腐蝕、重復性好、操作方便。進樣器的種類主要有六通進樣閥。氣動進樣閥和自動進樣器。
　　六通進樣閥是目前常用的。它的特點是進樣量的重復性非常好。但普通六通進樣閥在裝樣(LOAD)和進樣(INJECT)兩個位置之間流路被截斷時，會在扳閥過程中產生一個瞬間的高壓，非常容易引起流路的泄漏。現在比較好的六通迸樣閥由于采用了斷前接通技術，基本上消除了這種瞬間高壓，同時也大大減少了誤操作的可能。考慮到流動相的腐蝕，PEEK和陶瓷材料制成的六通進樣閥適合離子色譜儀使用。
　　氣動進樣閥是一種比較先進的進樣閥。它采用一定壓力的氮氣作為動力，通過兩路四通加載定量管進行裝樣和進樣，能有效減少手動進樣帶來的誤差，其不方便之處在于必須使用氮氣鋼瓶。
　　自動進樣器是一種自動化程度很高的系統，由軟件控制，自動進行裝樣、進樣、清洗，操作者只需將樣品按順序裝入貯樣機即可。自動進樣器價格比較昂貴，一般只有儀器才會配備。